Investigadores del Instituto de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica de Bellvitge (IDIBELL) han creado una aplicaci\u00f3n inform\u00e1tica, llamada MinerProt, que permite la clasificaci\u00f3n de prote\u00ednas seg\u00fan su funci\u00f3n. El sistema, creado en colaboraci\u00f3n con investigadores de la Universitat Polit\u00e8cnica de Catalunya (UPC) y la Universitat Pompeu Fabra (UPF), resulta \u00fatil para priorizar la importancia de ciertas prote\u00ednas. El estudio ha sido publicado en la revista Molecular BioSystems.<\/p>\n
El equipo, coordinado por la investigadora del IDIBELL \u00c0ngels Sierra, ha empleado esta herramienta junto con redes de interacci\u00f3n prote\u00edna-prote\u00edna para crear perfiles espec\u00edficos de expresi\u00f3n de prote\u00ednas para diferentes met\u00e1stasis de c\u00e1ncer de mama, en cerebro, pulm\u00f3n, h\u00edgado y hueso, estableciendo funciones prioritarias en cada una de ellas. La aproximaci\u00f3n funcional, basada en la selecci\u00f3n de las prote\u00ednas m\u00e1s representativas, puede servir para encontrar marcadores para predecir la evoluci\u00f3n del proceso canceroso, as\u00ed como para desarrollar futuras dianas terap\u00e9uticas.<\/p>\n
El principal objetivo de la investigaci\u00f3n ha sido buscar un clasificador funcional que ayude a interpretar todos los datos referentes a las prote\u00ednas relacionadas con las met\u00e1stasis del c\u00e1ncer de mama, dado el gran n\u00famero que se encuentra diferencialmente expresado y su complejidad de estudio. El clasificador indica las funciones celulares que pueden estar m\u00e1s representadas en un determinado tipo de c\u00e9lula metast\u00e1sica. \u201cSobre estas funciones, el clasificador nos indica qu\u00e9 prote\u00edna puede ser m\u00e1s importante para la funci\u00f3n que hemos integrado\u201d, explica Sierra, y contin\u00faa: \u201cpartiendo de genes\/prote\u00ednas previamente identificadas se clasifican atendiendo al grado de expresi\u00f3n diferencial (significaci\u00f3n estad\u00edstica) para luego organizarse en una red de interacci\u00f3n prote\u00edna-prote\u00edna. Es una forma pr\u00e1ctica de filtrar la informaci\u00f3n, seleccionando las prote\u00ednas clave para definir funciones relevantes. Hemos seguido un enfoque basado en discriminar las funciones de las met\u00e1stasis de c\u00e1ncer de mama atendiendo a su organoespecificidad que permitir\u00eda el crecimiento celular en microambientes de \u00f3rganos distantes como hueso, cerebro, h\u00edgado y pulm\u00f3n\u201d.<\/p>\n
Existen otros programas clasificadores similares, pero MinerProt prioriza la prote\u00edna mas representativa de cada grupo funcional, cosa que \u201cha ayudado a conocer los mecanismos moleculares caracter\u00edsticos de la organoespecificidad de las met\u00e1stasis\u201d, explica la Dra. Sierra.<\/p>\n
La met\u00e1stasis depende de m\u00faltiples y complejas interacciones. S\u00f3lo las c\u00e9lulas adaptadas tienen la capacidad de sobrevivir y crecer en un \u00f3rgano distante. \u201cIdentificar interacciones letales entre prote\u00edna y prote\u00edna en las c\u00e9lulas cancerosas es una v\u00eda prometedora para futuros desarrollos de dianas terap\u00e9uticas y de f\u00e1rmacos cada vez m\u00e1s potentes y selectivos\u201d, concluye Sierra<\/p>\n
El trabajo, financiado por la UE, el Instituto de Salud Carlos III, INCA, el Ministerio de Educaci\u00f3n y Ciencia, y la Asociaci\u00f3n Espa\u00f1ola Contra el C\u00e1ncer (AECC), se podr\u00eda comercializar en un futuro.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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