{"id":10021,"date":"2020-03-31T00:00:00","date_gmt":"2020-03-30T22:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/idibell.cat\/es\/blog\/2020\/03\/31\/un-estudio-piloto-de-secuenciacion-de-la-microbiota-intestinal-sienta-las-bases-para-la-busqueda-de-marcadores-de-deteccion-precoz-de-cancer-de-colon\/"},"modified":"2020-05-19T09:03:43","modified_gmt":"2020-05-19T07:03:43","slug":"un-estudio-piloto-de-secuenciacion-de-la-microbiota-intestinal-sienta-las-bases-para-la-busqueda-de-marcadores-de-deteccion-precoz-de-cancer-de-colon","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/idibell.cat\/es\/2020\/03\/un-estudio-piloto-de-secuenciacion-de-la-microbiota-intestinal-sienta-las-bases-para-la-busqueda-de-marcadores-de-deteccion-precoz-de-cancer-de-colon\/","title":{"rendered":"Un estudio piloto de secuenciaci\u00f3n de la microbiota intestinal sienta las bases para la b\u00fasqueda de marcadores de detecci\u00f3n precoz de c\u00e1ncer de colon"},"content":{"rendered":"

La microbiota intestinal, es decir, los microorganismos que viven en nuestros intestinos, nos pueden dar pistas del estado de salud de una persona, ya que su composici\u00f3n puede depender de factores como la dieta, el estilo de vida o de las patolog\u00edas que padecemos. Es m\u00e1s, saber qu\u00e9 bacterias concretas est\u00e1n en nuestros intestinos podr\u00eda ayudar a predecir enfermedades como el c\u00e1ncer de colon. Los nuevos avances en los m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n del genoma, y las herramientas bioinform\u00e1ticas que nos permiten analizar los datos, nos han ayudado a identificar miles de nuevos microorganismos presentes en nuestros intestinos a trav\u00e9s del an\u00e1lisis de su genoma.<\/p>\n

Un equipo formado por investigadores del Instituto de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica de Bellvitge (IDIBELL) y del Instituto Catal\u00e1n de Oncolog\u00eda (ICO), han realizado una prueba piloto en el an\u00e1lisis del genoma de la microbiota intestinal. En este estudio han analizado, por dos m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n diferentes, biopsias de colon y muestras fecales de nueve pacientes. El objetivo ha sido poner a punto las t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n y las herramientas de an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico.<\/p>\n

Se trata del primer trabajo de un proyecto que pretende ser mucho m\u00e1s extenso. Los datos obtenidos en esta prueba piloto servir\u00e1n de base para el dise\u00f1o del m\u00e9todo de an\u00e1lisis del proyecto Colonbiome<\/a>. Este gran proyecto tiene por objetivo buscar marcadores de la microbiota que puedan servir para la detecci\u00f3n precoz del c\u00e1ncer de colon. Para ello, se recoger\u00e1n biopsias de colon y muestras de heces de pacientes sanos, y pacientes en diferentes fases de c\u00e1ncer colorrectal, luego se secuenciar\u00e1 el genoma de la microbiota para identificar diferencias entre los grupos.<\/p>\n

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Datos al alcance de todos<\/h4>\n

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Todos los datos obtenidos en este estudio piloto han sido introducidos en la European Nucleotide Archive, una base de datos p\u00fablica y colaborativa, donde se comparten secuencias gen\u00f3micas de todo tipo para el aprovechamiento de toda la comunidad cient\u00edfica. Adem\u00e1s, todos los resultados de esta primera prueba piloto han sido publicados en la revista Scientific Data, revista tambi\u00e9n p\u00fablica, donde se han detallado tanto las secuencias como las f\u00f3rmulas de an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico utilizadas.<\/p>\n

Este estudio no s\u00f3lo pretende ser \u00fatil para los futuros trabajos del grupo, sino que gracias a su car\u00e1cter abierto y p\u00fablico pretende ser una ayuda a todos aquellos grupos de investigaci\u00f3n que est\u00e9n realizando an\u00e1lisis similares o probando nuevas herramientas bioinform\u00e1ticas, a los que se les pone al alcance todos los resultados obtenidos. Adem\u00e1s, los investigadores aseguran que tambi\u00e9n har\u00e1n p\u00fablicos todos los detalles de los estudios posteriores, para as\u00ed seguir contribuyendo en la colaboraci\u00f3n y el avance del campo.<\/p>\n

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Los dos m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n<\/h4>\n

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En el estudio se han comparado dos m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n: el 16s y el Shotgun. El primer descifra la secuencia de un solo gen de los microorganismos, mientras que el segundo nos da la secuencia completa de todo el genoma. Aunque al secuenciar un \u00fanico gen perdemos resoluci\u00f3n, puede resultar m\u00e1s econ\u00f3mico. Adem\u00e1s, el hecho de secuenciar un gen s\u00f3lo presente en la microbiota nos permite analizar muestras de biopsias sin que el genoma humano interfiera.<\/p>\n

Adicionalmente, la prueba piloto ha mostrado que ambas t\u00e9cnicas son consistentes. Aunque la secuenciaci\u00f3n completa es m\u00e1s sensible y distinguimos m\u00e1s especies de microorganismos, en ning\u00fan momento contradice los resultados obtenidos en secuenciar un \u00fanico gen.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

En este estudio piloto se han comparado dos m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n, utilizando muestras de biopsias de colon y muestras de heces de nueve pacientes. Tambi\u00e9n se han definido los m\u00e9todos de an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico m\u00e1s adecuados para este tipo de estudios.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":10022,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"no-sidebar","site-content-layout":"page-builder","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"default","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"default","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[184,296,281],"tags":[],"publishpress_future_action":{"enabled":false,"date":"2024-05-09 20:27:36","action":"change-status","newStatus":"draft","terms":[],"taxonomy":"category"},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10021"}],"collection":[{"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=10021"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10021\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/10022"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=10021"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=10021"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/idibell.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=10021"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}